Litvinchuk S.N. & Aksyonov N.D. & Borkin L.J. & Doronin I.V. & Erashkin V.O. & Kidov A.A. (2024) -
Genome size variation in diploid and polyploid mountain lizards of the genus Darevskia (Lacertidae, Squamata). - Zoologicheskii Zhurnal, 103 (11): 60-73. × The study of genome size variation in cells of vertebrates using the DNA flow cytometry makes it possible to precisely determine polyploid individuals, which is extremely important when studying the processes of reticulate speciation. In addition, in many groups of vertebrates, closely related species often differ in the nuclear DNA content. Therefore, the purpose of our study was to explore the variability of genome size and ploidy in populations of 29 species and subspecies of mountain lizards of the genus Darevskia, as well as their hybrids. As a result of the study, the range of variability in individuals of different ploidy (91% of diploid and 9% of triploid individuals) was established not to overlap. Among diploid species, no correlation was found between the nuclear DNA content and phylogenetic relationships, geographic coordinates, altitude, average annual temperatures and precipitation. Representatives of all studied species complexes (with the exception of D. adjarica) had approximately the same limits of variability. Two species (D. derjugini and D. saxicola) show significant intraspecific variability. Comparisons of the genome size of parthenogenetic and bisexual species generally revealed no noticeable differences between them. Studies of triploid hybrids have shown that their genome size as a whole roughly corresponds to the sum of the average size of the diploid genome of the maternal parthenogenetic species and the haploid genome of the paternal species. The variability of genome sizes within samples of triploid hybrids was on average slightly higher than in most parthenogenetic species, but some lower than in bisexual species. The paper discusses peculiarities of reticulate speciation in this group of animals.
С.Н. Литвинчукa, Н.Д. Аксеновa, Л.Я. Боркинc, И.В. Доронинc, В.О. Ерашкинd, А.А. Кидов (2024) -
Изменчивость размера генома у диплоидных и полиплоидных скальных ящериц рода Darevskia (Lacertidae, Squamata) - Зоологический Журнал, 103 (11): 60-73. × Измерение размера генома в клетках позвоночных животных с помощью прецизионного мето- да проточной ДНК-цитометрии позволяет безошибочно определять полиплоидных особей, что крайне важно при изучении процессов гибридогенного видообразования. Кроме того, во мно- гих группах позвоночных животных близкородственные виды часто различаются по количеству ядерной ДНК. Поэтому целью нашего исследования было изучение с помощью этого метода из- менчивости размера генома и плоидности в популяциях скальных ящериц рода Darevskia, а также их гибридов. В ходе исследования 29 видов и подвидов установлено, что размах изменчивости у особей с разной плоидностью (91% диплоидных и 9% триплоидных особей) не перекрывался. Среди диплоидных видов связи между количеством ядерной ДНК и филогенетическими вза- имоотношениями, географическими координатами, высотой, среднегодовыми температурами и количеством осадков выявлено не было. Представители всех изученных комплексов видов (за исключением D. adjarica) имели примерно одинаковые пределы изменчивости. У ряда видов (D. derjugini и D. saxicola) отмечена существенная внутривидовая изменчивость. Сравнение раз- мера генома у партеногенетических и бисексуальных видов в целом не выявило заметных разли- чий между ними. Изучение триплоидных гибридов показало, что их размер генома, как правило, примерно соответствует сумме среднего диплоидного размера генома материнского партеногене- тического вида и гаплоидного генома отцовского вида. Изменчивость по размеру генома внутри выборок триплоидных гибридов в среднем была несколько выше, чем у большинства партеноге- нетических видов, но чуть ниже, чем у бисексуальных видов. В статье обсуждаются особенности гибридогенного видообразования в данной группе животных.
Doronin I.V. & Doronina M.A. & Lotiev K.Yu. & Lukonina S.A. & Mazanaeva L.F. & Milto K.D. (2024) -
Genetic variation and phylogeography of Lacerta strigata Eichwald, 1831 (Lacertidae, Sauria). - Zoologicheskii Zhurnal, 103 (11): 40-59. × Seventy-six sequences of the cytb gene region of mitochondrial DNA (1143 bp) and 27 sequences of i7 β-fib nuclear DNA (483 bp) of Lacerta strigata from 57 localities in Abkhazia, Azerbaijan, Armenia, Georgia, Iran, and Russia were analyzed. A large number of new samples were included in analysis with special focus to the species’ range at the Caucasus Isthmus. An identical topology and four supported clades (lineages) resulted for both mtDNA and sequences combined with nucleDNA (Bayesian and Maximum Likelihood). Four haplogroups (clusters) have been identified in the median cytb haplotype network. The lizards of clade A (haplogroup I) are widespread throughout the species range, while lizards of clade D (haplogroup IV) show the most limited distrubytion. No genetically unique populations of L. strigata were detected in the Caucasian xerophilous refugia. Also, no genetically distinct populations of the species were recorded in the Hyrcanian climatic refugium (Southern Caspian region). An exception is the East Hyrcanian refugium, that is characterized by the most distant clade D (IV). The territory of Ciscaucasia and the Transcaucasian depression are occupied by a single clade each: A (I) and B (II), respectively. We detected several clades distributed in the four geographic areas (contact zones): in the Greater Caucasus, Alborz, Armenian Highland, and West Turkmenian Lowland. We associate the divergence of the L. strigata phylogenetic lineage with the Turkmen-Khorasan and, in particular, the Kopet Dag orogeny, as well as with the Late Miocene fluctuations in the level of the Eastern Paratethys, while the leading factor of intraspecific differentiation is the Pleistocene regressions and transgressions of the Caspian Sea. According to the current distribution pattern and species evolutionary history, L. strigata should be assigned to the Hyrcano-Caucasian zoogeographic group.
И.В. Доронинa, М.А. Доронинаa, К.Ю. Лотиевb, С.А. Луконинаd, Л.Ф. Мазанаеваe, К.Д. Мильтоa (2024) -
Генетическая изменчивость и филогеография полосатой ящерицы, Lacerta strigata Eichwald, 1831 (Lacertidae, Sauria) - Зоологический Журнал, 103 (11): 40-59. × Проведен анализ 76 последовательностей гена cytb митохондриальной ДНК (1143 п.н.) и 27 по- следовательностей интрона 7 β-fib ядерной ДНК (483 п.н.) Lacerta strigata из 57 локалитетов в Абхазии, Азербайджане, Армении, Грузии, Иране и России. Особое внимание уделено ранее неисследованным популяциям Кавказа. Наши данные позволили дополнить представления о генетическом разнообразии вида. Реконструировано два типа дендрограмм филогенетиче- ских отношений, показавших идентичную топологию и наличие четырех поддержанных клад (линий) как для мтДНК, так и для объединенного с яДНК набора последовательностей – байе- совская и максимального правдоподобия. На медианной сети гаплотипов cytb обособляются че- тыре гаплогруппы (кластера). Наибольшее распространение в ареале вида получили представи- тели клады A (гаплогруппа I), наименьшее распространение – D (IV). Для известных на Кавказе ксерофильных рефугиумов герпетофауны уникальные с генетической точки зрения популяции L. strigata не обнаружены. Аналогичное мы видим и при сопоставлении географического распре- деления клад со схемой расположения рефугиумов южного Прикаспия (Гиркании). Исключение составляет Восточно-Гирканский рефугиум, где выявлены только представители наиболее дис- танцированной клады D (IV). Такие обширные регионы, как Предкавказье и Закавказская де- прессия, по имеющимся данным, населены представителями единственной клады каждый: A (I) и B (II), соответственно. Выявлены четыре географические области, где обитают представители нескольких клад (контактные зоны): Большой Кавказ, Эльбурс, Армянское нагорье и Западно- Туркменская низменность. Мы связываем дивергенцию филогенетической линии L. strigata с формированием в позднем миоцене Туркмено-Хорасанских гор и, в частности, Копетдага, а также колебаниями уровня Восточного Паратетиса. Одним из ведущих факторов внутривидо- вой дифференциации вида могли быть плейстоценовые регрессии и трансгрессии Каспийского бассейна. Lacerta strigata должна быть отнесена к гиркано-кавказской зоогеографической группе.